La exploración de ciudades, mazmorras y mapa del mundo se realiza con vista cenital, mientras que los combates usan un sistema ATB por comandos en el que las acciones se habilitan al llenarse una barra de tiempo. El grupo cambia según la historia, y cada personaje tiene una clase fija con habilidades propias como magia negra, magia blanca, salto o invocaciones. El progreso depende de avanzar en la trama, superar mazmorras y gestionar bien equipo, estados alterados, afinidades elementales y recursos.

Mejora armas y armaduras con frecuencia al inicio, especialmente antes de las mazmorras largas. Tras el cambio de clase de Cecil, su resistencia aumenta mucho. Usa magia de área para acelerar los combates normales y reserva PM para los jefes, donde conviene explotar debilidades elementales. El salto de Kain sirve para esquivar ciertos ataques, mientras que Rosa debe priorizar curación y recuperación de estados. Guarda en varios archivos antes de momentos importantes y lleva suficientes objetos curativos.