Planifica la campaña en el mapa, mueve las unidades SD Gundam disponibles, resuelve batallas y avanza hacia el objetivo de unificación indicado por el escenario actual. La elección de unidades y el orden de los territorios afectan batallas posteriores, así que el juego no es solo una secuencia de combates aislados.

Explora el siguiente territorio, mantén una reserva para un contraataque y guarda una partida antes de elegir una ruta o desplegar una unidad clave. Compara las etiquetas de comandos de la secuela con los avisos japoneses cargados en lugar de asumir el orden exacto del menú del primer juego.