Biomechanical Toy utiliza una perspectiva lateral. El objetivo es recorrer una sucesión de fases, derrotar enemigos, evitar peligros y llegar al final de cada zona. Los niveles incluyen plataformas, huecos, desplazamientos verticales, obstáculos mecánicos y enfrentamientos.

El personaje puede moverse, saltar, atacar y recoger objetos útiles. La estructura arcade anima a aprender los patrones de los enemigos y la disposición de las fases mediante intentos repetidos. Como la configuración puede variar según la máquina, no se especifica una asignación concreta del joystick y los botones.

Observa el movimiento de los enemigos antes de avanzar, sobre todo en las secciones con plataformas estrechas. En las zonas desconocidas, ataca desde una posición segura en vez de avanzar con prisa.

Memorizar la disposición de las fases ayuda a conservar vidas. Las secciones avanzadas exigen saltos precisos y reacciones rápidas, por lo que repetir las partidas resulta útil para aprender el terreno y las posiciones de aparición de los enemigos.