Avanza por rutas y pueblos de desplazamiento lateral, derrota enemigos con la pipa de Goemon, recoge dinero y objetos, entra en tiendas o zonas de bonificación y continúa hacia el objetivo de la fase. El juego combina plataformas con exploración y breves transiciones de mapa.

Reúne suficiente dinero para objetos útiles sin recibir golpes innecesarios, busca tiendas y pistas en los pueblos y aprende qué ataques enemigos pueden interrumpirse con la pipa. Explora rutas alternativas cuando el camino directo tenga un salto difícil o falte algún objeto.