Explora el Mundo del Equilibrio y el Mundo de la Ruina desde una perspectiva cenital, visita ciudades, cruza el mapa y entra en mazmorras como Narshe, el castillo de Figaro, Zozo y el Continente Flotante. Al principio, los acontecimientos siguen capítulos guiados por la historia; en el Mundo de la Ruina hay más libertad para reclutar personajes y recuperar equipo.

Los combates utilizan barras de Active Time Battle. Elige comandos como Fight, Item y las habilidades propias de cada personaje, y mejora al grupo con armas, armaduras, reliquias, magia, Espers y niveles. Es principalmente una aventura para un jugador, aunque un segundo jugador puede controlar personajes de forma limitada durante los combates si se activa la opción correspondiente en la configuración del mando.

Usa reliquias para especializar a los personajes y forma grupos con atacantes físicos, usuarios de magia y personajes de apoyo. Aprovecha las debilidades elementales y los estados alterados en lugar de depender solo de los ataques normales.

En el Mundo de la Ruina, recluta a los personajes opcionales y recupera el equipo importante antes del asalto final a la torre de Kefka. Guarda la partida con frecuencia antes de las mazmorras importantes, ya que la estructura de tres grupos de la torre exige preparar varios grupos.