Los jugadores guían al personaje principal por los stages disponibles de Mario & Flybro: The Mysterious Mansion: se mueven, saltan, usan los ataques o habilidades activas, recogen objetos, evitan peligros y alcanzan las salidas u objetivos del escenario. Pon a prueba el área de apertura para identificar las reglas actuales de movimiento, colisión, enemigos y progresión, ya que el ROM exacto puede diferir de las versiones relacionadas.

Comienza en un área segura y aprende los controles activos, el objetivo, el tiempo y los límites de recursos antes de comprometer avance en Mario & Flybro: The Mysterious Mansion. Mantén un guardado aparte para esta plataforma y versión exactas, conserva un estado antes de jefes, transiciones largas o decisiones importantes cuando sea posible, y registra la etiqueta del ROM, la pantalla y la acción cuando el comportamiento difiera de una versión relacionada.