El jugador controla a Mario en escenarios 3D al estilo de Super Mario 64, saltando, explorando y recolectando objetivos para avanzar. Al pulsar L, Cappy se lanza hacia delante; si golpea a un enemigo o a ciertos objetos, Mario puede tomar el control de ese objetivo y obtener nuevas habilidades. Si no hay un blanco disponible, Cappy gira y mantiene a Mario suspendido brevemente en el aire, útil para ajustar saltos y corregir trayectorias. La progresión se apoya en niveles tipo misión, desafíos de plataformas y acertijos ambientales.

Aprende primero el alcance del lanzamiento y el momento exacto de captura de Cappy, ya que muchas rutas dependen de ello. En saltos difíciles, usa a Cappy para estabilizarte en el aire antes de encadenar el doble salto. Siempre que puedas, captura enemigos, porque algunos facilitan mucho cruzar huecos grandes o alcanzar zonas altas.