La acción se muestra desde una perspectiva lateral. Cada fase contiene una zona de combate compacta con Medabots enemigos, obstáculos y algunas secciones de plataformas. El objetivo es derrotar a los rivales mientras se protege la pieza de la cabeza de Metabee.

El jugador puede moverse, saltar, disparar y realizar ataques cuerpo a cuerpo. Las victorias permiten acceder a nuevas piezas y cambiar la configuración de combate de Metabee. La versión Metabee se centra en las armas a distancia y ofrece una experiencia distinta de la versión Rokusho, aunque ambas comparten una estructura general.

Mantente en movimiento en lugar de intercambiar golpes desde una posición fija. Conserva la distancia frente a los enemigos cuerpo a cuerpo y dispara cuando dejen una abertura.

Protege la pieza de la cabeza de Metabee, ya que su destrucción provoca la derrota. Cambia las piezas disponibles según el rival y estudia sus patrones antes de acercarte.