Mega Man recorre fases laterales con plataformas, escaleras, trampas y enemigos. Puede correr, saltar, deslizarse, disparar con el Mega Buster y cargar los disparos después de obtener la capacidad correspondiente. Cada fase de Robot Master termina con un jefe, y el arma de un jefe puede ser eficaz contra otro.

Al principio hay cuatro fases disponibles; la historia amplía el recorrido después de ciertos acontecimientos. Los jefes derrotados proporcionan armas nuevas. Las habilidades de Rush y los objetos ocultos mejoran el movimiento, la munición o la resistencia. Las contraseñas guardan el progreso.

Aprende las debilidades de los Robot Masters y prepara un orden de fases. Las cuatro primeras fases admiten varias rutas, pero usar el arma adecuada facilita cada combate contra un jefe.

Busca desvíos y habitaciones ocultas para conseguir tanques y mejoras. Practica el momento del deslizamiento y la distancia de los disparos cargados; reserva la energía de las armas para los enfrentamientos importantes.