La exploración se realiza con una vista superior. El jugador recorre Hoenn, habla con personajes, recoge objetos y supera obstáculos. Las criaturas salvajes aparecen en hierba alta, cuevas y zonas de agua.

Los combates son por turnos. Se pueden elegir ataques, objetos o cambios de criatura. Los tipos, las estadísticas, los estados alterados y la experiencia influyen en el resultado. La progresión incluye capturar y entrenar criaturas, aprender movimientos, evolucionar y derrotar a los líderes de gimnasio.

Forma un equipo equilibrado con varios tipos elementales en lugar de depender de una sola criatura. Mantén a varios miembros en niveles parecidos y lleva objetos de curación antes de entrar en cuevas o enfrentarte a rivales y gimnasios.

Ten en cuenta los tipos de los movimientos y los estados alterados. Cura al equipo con frecuencia en los Centros Pokémon, guarda antes de los combates importantes y consulta la Pokédex para revisar debilidades y evoluciones.