El juego utiliza una perspectiva bidimensional con desplazamiento horizontal. Hay que atravesar cada zona, derrotar enemigos, evitar peligros y llegar al jefe o al objetivo de la misión.

Las fases se centran en moverse, saltar, atacar y emplear determinadas técnicas ninja. La progresión depende de las misiones, no de la experiencia: completar una fase permite avanzar a los desafíos posteriores. La versión de Game Boy Advance está diseñada para un jugador.

Aprende primero el ritmo del ataque básico. Mantente en movimiento entre los grupos de enemigos, usa los saltos para evitar el contacto y espera una abertura segura contra los rivales más resistentes.

En las secciones de plataformas desconocidas, avanza con cuidado. Guarda la salud y los recursos especiales para los jefes; colocarse pacientemente suele ser más seguro que atacar sin parar desde cerca.