La exploración se realiza con una perspectiva cenital. El jugador recorre Hoenn, captura Pokémon, combate contra Pokémon salvajes y entrenadores, consigue medallas y avanza hacia la Liga Pokémon.

Los combates son por turnos y utilizan movimientos, objetos, habilidades, tipos y estados alterados. Los encuentros y los equipos de entrenadores han sido revisados, e incluye elementos de generaciones posteriores.

Forma un equipo equilibrado con distintos tipos y funciones. Comprueba las habilidades, la cobertura de movimientos y los objetos del rival antes de los combates importantes.