Hoenn se explora desde una perspectiva cenital, recorriendo ciudades, rutas, cuevas, zonas marítimas y otros lugares. El objetivo principal es conseguir ocho medallas, derrotar al Alto Mando y convertirse en Campeón de la Liga Pokémon.

Los encuentros salvajes y los combates contra Entrenadores son por turnos. Los Pokémon ganan experiencia, aprenden movimientos y evolucionan. El jugador forma un equipo de hasta seis Pokémon, captura, pesca, intercambia, participa en Concursos y continúa explorando después de superar la Liga.

Forma un equipo con tipos variados y mantén sus niveles equilibrados. Aprovecha las ventajas de tipo en vez de depender de un único atacante, y lleva objetos de curación para las rutas y cuevas largas.

Elige con cuidado los movimientos MO: son necesarios para explorar, pero no siempre son buenos en combate. Comprueba el tipo del siguiente gimnasio y cura al equipo con frecuencia en los Centros Pokémon.