El juego usa una estructura clásica de RPG de GBA con vista cenital, exploración de islas y rutas celestes, diálogos y combates por turnos. El progreso avanza mediante eventos de historia, objetos clave y derrotas de entrenadores importantes que desbloquean nuevas zonas. La gestión del equipo, la elección de movimientos y la ventaja de tipos son esenciales, mientras que algunas secciones ponen más énfasis en el viaje aéreo y la navegación del mapa.

Forma un equipo equilibrado que pueda responder a amenazas de tipo Volador y Eléctrico. Antes de las rutas celestes largas, lleva suficientes objetos de curación y de estado, y guarda la partida antes de los combates importantes. Explorar caminos secundarios suele dar objetos ocultos y experiencia extra. Aprender pronto la conexión entre islas reduce mucho los retrocesos.