El jugador escoge a Rockman, Blues o Forte y avanza por una serie de combates contra jefes. Cada enfrentamiento tiene lugar en una arena única, donde hay que estudiar los patrones enemigos, esquivar y contraatacar.

Las acciones principales son moverse, saltar, disparar con el arma estándar y usar las armas obtenidas de los jefes derrotados. El objetivo es completar la ruta elegida y vencer al rival final. La estructura favorece los combates rejugables por encima de la exploración.

Ahorra la energía de las armas especiales cuando su ventaja no sea evidente. El disparo estándar ayuda a conservar energía, mientras que el arma adecuada puede acortar mucho un combate difícil.

Observa el ritmo de los ataques, usa los saltos contra los golpes previsibles y no permanezcas mucho tiempo delante del jefe. Repetir combates anteriores ayuda a aprender el momento de uso de cada arma y la distancia segura.