Los jugadores dejan caer y rotan Puyos de colores, eliminan grupos, crean cadenas y resuelven condiciones de tablero específicas de cada escenario. La secuela puede introducir nuevos objetivos o distribuciones, por lo que conviene probar el reto inicial y leer las instrucciones en japonés antes de aplicar estrategias del primer juego.

Lee primero el objetivo, reserva espacio para los colores necesarios y construye cadenas controladas en lugar de llenar el tablero a ciegas. Mantén la partida de la secuela separada de las primeras entregas de Nazo Puyo y realiza un guardado antes de una secuencia difícil de puzles si está disponible.