El jugador recorre la academia desde una perspectiva cenital, asiste a clases, habla con estudiantes, compra cartas y elige rivales. Los acontecimientos de la historia y los exámenes siguen el calendario escolar, mientras que el tiempo libre permite prepararse y mejorar el mazo.

Los duelos se desarrollan por turnos. Hay que invocar monstruos, colocar cartas Mágicas y Trampa, administrar los puntos de vida y aprovechar las sinergias del mazo. Las victorias aumentan el rango escolar y desbloquean acontecimientos, rivales y cartas.

Construye el mazo alrededor de unos pocos temas compatibles en vez de incluir todas las cartas poderosas que tengas. Comprueba su consistencia, equilibra monstruos, Mágicas y Trampas, y elimina las cartas difíciles de utilizar.

Aprovecha bien los días lectivos, consigue cartas con frecuencia y prepárate antes de los exámenes. Estudia las estrategias habituales de cada rival y conserva respuestas de eliminación, defensa o recuperación.