A perspectiva é lateral. O jogador controla Dixie ou Kiddy, atravessa fases, derrota inimigos, coleta bananas, Bonus Coins e Bear Coins e chega ao final de cada nível.

Dixie pode girar o rabo de cavalo para planar brevemente, enquanto Kiddy, mais pesado, consegue atravessar a água com um salto rolante. É possível carregar e arremessar barris, usar animais aliados e alternar entre os dois Kongs. O mapa oferece rotas opcionais, lojas, minijogos e deslocamento por veículos. Bonus Areas e saídas secretas aumentam o progresso total.

Use Dixie para saltos longos e movimentos precisos, e Kiddy para objetos pesados, saltos sobre a água e certos inimigos.

Procure Bonus Barrels, saídas secretas e Bear Coins em todas as fases. Volte ao mapa depois de obter um veículo novo, pois algumas áreas só ficam acessíveis mais tarde.

Gaste Bear Coins com cuidado e salve com frequência. As habilidades dos animais aliados costumam revelar atalhos ou entradas para Bonus Areas.