O jogador lidera uma equipe de Pokémon por masmorras em grade com visão superior, movendo-se e agindo por turnos. As missões geralmente envolvem resgate, escolta, exploração ou recuperação de itens, avançando a história e liberando novas áreas. O hack dá mais peso ao planejamento de rotas, ao controle de status e ao gerenciamento de recursos, enquanto a geração revisada das masmorras e os eventos ligados ao karma podem mudar o rumo de cada partida.

Monte uma equipe equilibrada com dano, suporte e cura, e leve itens de recuperação, cura de status e ressurreição antes de descer para andares mais profundos. Sempre que possível, lute em corredores estreitos para enfrentar inimigos um por um e evite salas abertas com vários oponentes. Se o karma ou escolhas afetarem o resultado, salve antes de momentos importantes e encare eventos opcionais com cautela.