A exploração usa uma perspectiva superior e os encontros com Pokémon selvagens e Treinadores acontecem em combates por turnos. O objetivo é obter insígnias, desenvolver a equipe e avançar pela história de Johto antes de enfrentar Kanto e os desafios finais.

O jogador percorre cidades, rotas e cavernas, captura Pokémon, administra golpes e itens, supera obstáculos ambientais e enfrenta rivais. Insígnias, níveis, evoluções e habilidades de campo liberam novas áreas gradualmente.

Monte uma equipe com tipos variados em vez de depender de um único Pokémon forte. Mantenha vários integrantes em níveis próximos, pois líderes de Ginásio e adversários do fim do jogo podem explorar equipes pouco diversificadas.

Leve itens de cura e Poké Balls antes de entrar em rotas ou cavernas longas. Salve antes de batalhas importantes e use vantagens de tipo, golpes de status e itens equipados.