O jogo usa uma visão de cima no estilo GBA, com exploração de cidades, rotas, cavernas e instalações para avançar a história. A progressão gira em torno de capturar Pokémon, montar uma equipe e enfrentar líderes de ginásio e a Elite Four. As batalhas seguem o sistema tradicional por turnos, em que vantagem de tipo, escolha de golpes e efeitos de status decidem o resultado. As novas espécies e linhas evolutivas ampliam bastante as opções de estratégia e composição de equipe.

Monte uma equipe com cobertura ampla de tipos, em vez de repetir funções parecidas. Ao usar uma nova evolução, guarde itens úteis e MTs importantes com antecedência para integrá-la mais facilmente. Antes de uma batalha de ginásio, prepare respostas contra o tipo dominante e leve golpes de status como sono ou paralisia. Um lead rápido com golpe prioritário torna combates difíceis bem mais seguros.