O jogo mantém a visão de cima clássica de Pokémon, com exploração de cidades, rotas, cavernas e ginásios, além de encontros aleatórios e batalhas em turnos. O jogador conquista insígnias, captura Pokémon selvagens e avança pela história aos poucos. O elenco jogável é limitado a 199 Pokémon, incentivando uma equipe mais focada. EXP.ALL reduz o grind, TMs podem ser usadas sem limite e pedras evolutivas podem ser compradas nas lojas, deixando o progresso bem mais prático.

Monte cedo um time equilibrado com base nos Pokémon de Johto e aproveite as facilidades do hack. Como o EXP.ALL está ativado, você não precisa treinar cada membro separadamente, mas ainda vale priorizar cobertura de tipos nos atacantes principais. Compre pedras evolutivas assim que possível e evolua os Pokémon centrais no momento certo. Para ginásios e Elite Quatro, prepare respostas para ameaças dos tipos Voador, Psíquico e Dragão.