A partida usa uma perspectiva lateral. O jogador atravessa fases lineares, derrota inimigos, evita perigos, coleta itens e alcança o objetivo de cada fase. Wolverine se concentra no combate corpo a corpo, Noturno usa teletransporte para se mover e atacar, e o Homem de Gelo emprega ataques de gelo à distância.

A campanha alterna entre os três heróis e avança por fases, sem mundo aberto. É preciso aprender os padrões dos inimigos, escolher a habilidade mutante adequada e administrar a vida durante confrontos prolongados. As lutas contra chefes são os principais aumentos de dificuldade.

Escolha o herói mais adequado para cada situação. Wolverine é eficaz quando é seguro se aproximar, Noturno é útil para mobilidade e evasão, e o Homem de Gelo consegue controlar o espaço mantendo distância.

Aprenda o momento certo de usar teletransporte, saltos e ataques de gelo antes das áreas difíceis. Guarde vida para os chefes, observe as armadilhas e não avance contra grupos quando houver uma rota segura ou um ataque à distância disponível.