Alien Trilogy se juega desde una perspectiva en primera persona. Ripley recorre pasillos, laboratorios, zonas militares e instalaciones infestadas, completa objetivos, encuentra objetos de acceso y busca los puntos de extracción.

La campaña está dividida en misiones con objetivos y encuentros distintos. El jugador recoge munición, armas, armadura y suministros, y decide cuándo luchar o evitar las amenazas. Los Xenomorfos atacan rápidamente a corta distancia, por lo que las armas de fuego y conocer el diseño de los niveles son esenciales.

Ahorra munición usando el arma adecuada para cada enemigo y no gastes explosivos potentes contra objetivos aislados. Busca suministros en las habitaciones secundarias antes de las secciones de combate prolongadas.

Aprende el diseño de cada misión y presta atención a las emboscadas junto a puertas, conductos y pasillos estrechos. Retroceder a una zona ya despejada suele ser más seguro que luchar contra varios Xenomorfos en un espacio cerrado.