La acción se presenta con desplazamiento lateral. Ben recorre fases lineales, derrota grupos de enemigos, evita peligros, recoge objetos y llega al objetivo o al enfrentamiento final de cada fase.

El Omnitrix permite utilizar varias formas alienígenas. Cada una posee ataques y habilidades de movimiento distintas, así que hay que escoger la transformación adecuada para cada situación. La aventura se divide en fases narrativas con combates contra jefes y algunas secuencias parecidas a minijuegos.

Usa la forma alienígena más adecuada para cada situación en lugar de depender siempre de la misma.

Observa los patrones de ataque antes de acercarte cuando haya varios enemigos. Revisa los caminos secundarios y los objetos rompibles, y reserva los ataques fuertes para los jefes y los grupos numerosos.