El jugador explora ciudades, campos, ruinas, mazmorras y distintas épocas desde una perspectiva cenital. Los objetivos son reunir aliados, investigar los cambios de la historia y derrotar amenazas relacionadas con el futuro.

Los combates tienen lugar directamente en el escenario. Los personajes emplean ataques físicos, objetos, Técnicas individuales y Técnicas dobles o triples. La experiencia y el equipo fortalecen al grupo, mientras que ciertas decisiones y misiones opcionales pueden afectar al final. New Game+ conserva el progreso y permite acceder a finales adicionales.

Forma el grupo según la complementariedad de sus Técnicas y no solo por nivel. Las Técnicas dobles y triples son muy útiles contra los jefes; la protección contra estados y elementos puede ser más importante que la defensa básica.

Regresa a las eras anteriores después de los acontecimientos importantes para encontrar misiones y equipo opcionales. Guarda antes de las decisiones clave si quieres explorar distintos finales. New Game+ es la forma más eficaz de ver los finales que exigen una progresión poco habitual.