La exploración utiliza una vista superior para recorrer ciudades, zonas y mazmorras. El objetivo es completar misiones, investigar la crisis del Mundo Digital y preparar al equipo para enfrentarse a enemigos cada vez más fuertes.

Los combates son por turnos y permiten usar hasta tres Digimon activos, además de reservas. Se eligen ataques, técnicas, objetos y defensa, mientras se administran atributos, tipos, equipo y coste de técnicas. Los Digimon pueden reclutarse, escanearse, involucionar, evolucionar y entrenarse en granjas. La experiencia, las misiones, el equipo y los requisitos de evolución determinan el progreso.

Forma un equipo equilibrado con distintos atributos, tipos de ataque y técnicas de apoyo. Una composición variada responde mejor a las diferentes defensas enemigas.

Usa las granjas para mejorar estadísticas y cumplir requisitos de ABI. La involución puede abrir mejores rutas evolutivas; guarda antes de tomar decisiones importantes y conserva varios Digimon para cumplir requisitos de misiones.