A aventura é dividida em dois cenários refeitos, baseados nas duas primeiras experiências de Megami Tensei. O jogador explora labirintos em primeira pessoa, cidades, templos e torres em busca de caminhos, itens, chaves e eventos da história.

Nas batalhas por turnos, é possível atacar, lançar magias, usar itens, negociar com demônios, recrutá-los e realizar fusões. O progresso depende de experiência, equipamentos, gerenciamento de magia e conhecimento do layout de masmorras cada vez mais complexas.

Faça mapas das masmorras importantes e marque portas trancadas, passagens de mão única, pontos de cura e locais de teleporte. Voltar regularmente à cidade é mais seguro do que avançar com pouca magia e poucos itens de cura.

Use negociação e fusão de demônios com frequência. Um demônio fraco ainda pode ser útil por causa de uma magia ou resistência específica, enquanto a fusão ajuda a manter um grupo mais forte e versátil. Verifique as fraquezas dos inimigos antes de gastar MP limitado.