O jogo usa uma perspectiva lateral bidimensional. Bart atravessa várias fases inspiradas em Springfield, cada uma ligada a um objetivo diferente do plano alienígena.

Ele pode pular, percorrer plataformas, usar objetos da fase e ativar sua visão de raios X para encontrar alienígenas disfarçados ou alvos importantes. O progresso depende da observação e da interação com o ambiente.

As tarefas incluem remover objetos de cor alienígena e revelar invasores escondidos. Completar o objetivo leva à fase seguinte, enquanto a saúde e as vidas limitadas exigem cautela.

Confira o objetivo da fase antes de avançar rapidamente. Os alvos corretos do cenário costumam ser mais importantes do que derrotar inimigos.

Use a visão de raios X quando um personagem ou objeto parecer suspeito. Aprenda os padrões dos inimigos e evite contatos desnecessários.

Em desafios com limite de tempo, faça primeiro os objetivos obrigatórios e memorize as áreas perigosas.