A ação é apresentada em visão lateral. Mega Man escolhe entre oito fases dos Robot Masters, supera inimigos e armadilhas e enfrenta um chefe no final de cada fase.

Os chefes derrotados concedem armas especiais. O jogador alterna entre o Mega Buster e as armas obtidas para explorar fraquezas e planejar a ordem das fases. Depois dos oito Robot Masters, vêm as fases do Dr. Wily e a batalha final.

Aprenda o desenho das fases e procure uma ordem que aproveite as fraquezas dos chefes. Metal Blade é bastante versátil e ajuda em vários confrontos.

Use E-Tanks quando uma derrota obrigaria a refazer um trecho longo. Examine plataformas e passagens suspeitas, mas não arrisque uma vida por todos os itens.