A ação acontece em perspectiva lateral, em fases bidimensionais. No início, o jogador escolhe uma entre oito fases dos Robot Masters; ao derrotar um chefe, recebe sua arma especial.

Mega Man corre, pula, atira, desliza e sobe escadas enquanto enfrenta inimigos e obstáculos. As armas especiais exploram as fraquezas dos chefes, e Rush oferece diferentes formas de suporte. Depois das fases iniciais, vêm as fases da fortaleza, com revanche contra chefes e confrontos finais.

Aprenda a ordem das fraquezas dos chefes e economize a energia das armas especiais. O Mega Buster é confiável na maioria das situações; guarde as armas eficazes para os confrontos mais importantes.

A deslizada permite passar sob projéteis e obstáculos baixos. Rush Coil e Rush Jet ajudam nas áreas com saltos difíceis. Verifique paredes e pisos suspeitos para encontrar energia, energia de armas e vidas extras.