O jogador guia o personagem principal pelas fases disponíveis de Mega Man X5 Improvement Project Addendum: mova-se, pule, use os ataques ou habilidades ativas, colete itens, evite perigos e alcance as saídas ou os objetivos do cenário. Teste a área inicial para identificar as regras atuais de movimento, colisão, inimigos e progressão, pois a ROM exata pode diferir de versões relacionadas.

Comece em uma área segura e aprenda os controles ativos, o objetivo, o ritmo e os limites de recursos antes de comprometer o progresso em Mega Man X5 Improvement Project Addendum. Mantenha um save separado para exatamente esta plataforma e versão, preserve um estado antes de chefes, transições longas ou escolhas importantes quando houver suporte, e registre o rótulo da ROM, a tela e a ação quando o comportamento diferir de uma versão relacionada.