A visão lateral acompanha fases lineares em ruas, obras, esgotos e outros cenários. O jogador avança, pula, ataca soldados do Foot e normalmente enfrenta um chefe no fim de cada fase.

Cada tartaruga tem alcance, velocidade e equilíbrio de ataque próprios. A pizza recupera energia, enquanto A+B ativa um ataque especial limitado que consome energia. O modo para dois jogadores permite cooperação simultânea. A progressão ocorre ao concluir fases, sem experiência ou equipamentos.

Use o alcance de cada tartaruga. Donatello consegue atacar de uma distância segura, enquanto Raphael precisa se aproximar. Pule por cima de grupos muito numerosos em vez de trocar golpes com todos.

Guarde o ataque especial para ondas densas ou chefes. No modo para dois jogadores, evitem bloquear o movimento um do outro e reagrupem-se perto de pizzas ou quando o chefe ficar vulnerável.

Observe os padrões dos inimigos a partir da borda da tela e evite danos desnecessários antes das lutas contra chefes.